La causa de la avería fue haber trasegado por error agua al tanque de consumo. El remolque de auxilio se realizó por un barco de la armada sudafricana.
El 23 de octubre, el AFRICANA había iniciado la campaña anual de investigación pesquera programada en 50 días por el Ministerio de Agricultura, de Bosques y de Pesca. Cuando se produjo el incidente casi se había completado el programa de investigación de las especies pelágicas de la región de la costa oeste sudafricana.
En principio, el inicio de la campaña se había fijado para mediados de abril. En el mes de mayo, el citado organismo se vio obligado a posponer todo el programa debido al deficientísimo estado de mantenimiento general del AFRICANA, con problemas de corrosión en tuberías, las grúas oxidadas, extintores contraincendios caducados, deficiente estado de válvulas de la maquinaria y fugas de aceite en el generador auxiliar.