El puerto de Huelva ha destinado más de 2,7 millones de euros a distintas actuaciones en materia de seguridad ferroviaria sobre todo a trabajos de señalización. Las actuaciones ejecutadas y recogidas en el proyecto han consistido en llevar a cabo el suministro e instalación de servidores CTC y MIE programados para un nuevo centro de control de tráfico centralizado (CTC) del enclavamiento en el puerto de Huelva. Asimismo, dentro de esta actuación se han realizado tareas de formación del personal propio del puerto en la operación y mantenimiento de las instalaciones de Seguridad Ferroviarias.
Otra de las actuaciones destacadas ha sido la automatización de portones de vía que habilitan la entrada y salida de vehículos ferroviarios en la infraestructura de la Autoridad Portuaria de Huelva. Con estas actuaciones se permite interrelacionar el enclavamiento con el resto de soluciones funcionales y tecnológicas como puede ser el gestor de capacidad ferroviaria, accionamiento de portones de acceso ferroviario del Puerto, mejora de la seguridad en la línea de conexión con la RFIG del ADIF por aumento de la longitud entre señales y vía general. En cuanto a las conexiones ferroviarias actuales en el puerto de Huelva, desde el Muelle Sur operan varios trenes semanales hacia Madrid, así como desde el Muelle Sur hacia Majarabique (Sevilla).
