En materia comercial, una línea exportadora de la biomasa forestal une el Baix Empordà con Italia a través del puerto de Palamós, el único enclave gestionado por la Generalitat en la costa gerundense con tráfico de mercancías.
El puerto especializado en carga general movió 213.467 toneladas de mercancía durante el año 2014. De este volumen un 43,6% se destinó al mercado europeo: forraje granulado (2.009 toneladas) hacia Grecia y el resto de productos como biomasa forestal y madera (80.600 toneladas) y posos de café (10.481 toneladas), que se exportaron a Italia para transformarlos en energía.
Asimismo, el puerto importa mercancías de América del Norte y del Sur, Asia, la Unión Europea y el Magreb. En 2014 se operaron en este enclave: pasta de papel (80.178 toneladas), barita (20.546 toneladas), escoria (15.372 toneladas), productos siderúrgicos (4.185 toneladas) y mercancía general (96 toneladas).
Por otra parte, las navieras italianas apuestan por Palamós con sus cruceros. Desde el 2011 la compañía MSC Crociere ya ha visitado el enclave con los barcos MSC MELODY y MSC SINFONIA. Y esta temporada la naviera Costa Crociere prevé estrenarse en el puerto con tres escalas del COSTA MÁGICA.